
?ChIP-Seq
概述:染色質免疫共沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結合位點分析法,是研究體內蛋白質與DNA 相互作用的有力工具,通常用于轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將ChIP 與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq 技術,能夠高效地檢測全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段。
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染色質免疫共沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結合位點分析法,是研究體內蛋白質與DNA 相互作用的有力工具,通常用于轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將ChIP 與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq 技術,能夠高效地檢測全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段。
ChIP-Seq 的原理是:首先通過染色質免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA 片段,并對其進行純化與文庫構建;然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA 區段信息。
ChIP-Seq 的原理是:首先通過染色質免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA 片段,并對其進行純化與文庫構建;然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA 區段信息。
樣品要求
1、質量要求:ChIP DNA OD 260/280應在1.8至2.0之間。DNA片段大小在100-500 bp范圍內,主帶明顯,建議在250 bp左右,同時請提供DNA打斷時的檢測膠圖。樣品最好經過ChIP-PCR驗證。
2、濃度要求:樣品量≥60 ng,濃度≥200 pg/μl。若單次ChIP后DNA量不夠,建議將2-3次ChIP的DNA合并在一起。
3、樣品包裝:樣品溶于超純水中,放于DNase-free的1.5 ml離心管中,管口用封口膜封好。請在樣品管上做好清楚的標識,最好寫在標簽紙上,貼在管壁。
4、樣品信息:請仔細填寫樣品信息表,并且請同時提供質量檢測相關數據和圖片,包括分光光度、電泳膠圖或Nanodrop儀器檢測數據等。同樣品一起送樣。
5、樣品運輸:DNA樣品請用干冰或者冰袋運輸。干冰運輸時間不要超過72小時;冰袋運輸,時間最好不要超過24小時。
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