
?環境微生物多樣性檢測
概述: 環境微生物群落多樣性分析,基于Illumina HiSeq 2500和HiSeq 4000、Illumina MiSeq等第二代高通量測序平臺,對核糖體RNA高變區域,比如16S/18S/ITS等序列;或功能基因,比如細菌和古菌的氨氧化酶基因進行測序,揭示環境樣品中眾多不同類型微生物種類以及它們之間的相對豐度和進化關系。探討微生物多樣性,對于研究微生物與環境的關系、環境治理和微生物資源利用有著重要的理論和現實意義。
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信息分析
常見問題
環境微生物多樣性檢測,是以樣品中的微生物群落作為整體進行研究,通過對核糖體RNA高變區域(比如16S/18S/ITS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)進行PCR擴增和測序,然后分析相應環境下微生物群落的多樣性和分布規律。
應用領域
應用領域

樣品要求
1、樣品采集:樣品采集條件的一致是最為重要的環節,嚴格按照采樣標準采樣,采樣后立即封存樣品冷凍保存。
2、樣品DNA:環境因素異常復雜,許多物質或抑制因子影響后續PCR、測序文庫構建和序列測定,常規提取方法不一定適合,建議采用專用試劑盒提取。提供濃度≥20 ng/μl,總量≥500 ng的基因組DNA,并確保電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整;基因組DNA完全無降解;提供DNA電泳檢測照片,用自封袋密封后隨樣品一起送樣。組織樣品>1.5 g。
3、樣品保存期間切忌反復凍融。
4、送樣管務必標清樣品編號,管口使用Parafilm膜密封。
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