
?宏基因組de novo測序
概述:宏基因組de novo測序是指對環境樣品中所有微生物基因組DNA片段化后進行高通量測序,進行序列組裝和基因注釋,獲得部分不可純培養微生物的基因組序列,分析該環境下所有微生物基因集信息。
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信息分析
常見問題
宏基因組de novo測序是指對環境樣品中所有微生物基因組DNA片段化后進行高通量測序,進行序列組裝和基因注釋,獲得部分不可純培養微生物的基因組序列,分析該環境下所有微生物基因集信息。
通過宏基因組de novo測序,能夠解釋微生物群落多樣性、種群結構、進化關系、功能活性及環境之間的相互協作關系,極大地擴展了微生物學研究范疇。
通過宏基因組de novo測序,能夠解釋微生物群落多樣性、種群結構、進化關系、功能活性及環境之間的相互協作關系,極大地擴展了微生物學研究范疇。
應用領域

樣品要求
1、樣品采集:樣品采集條件的一致是最為重要的環節,嚴格按照采樣標準采樣,采樣后立即封存樣品冷凍保存。
2、樣品DNA:環境因素異常復雜,許多物質或抑制因子影響后續PCR、測序文庫構建和序列測定,常規提取方法不一定適合,建議采用專用試劑盒提取。PE文庫DNA濃度≥20 ng/μl,總量≥6 μg(熒光定量),并確保電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整;基因組DNA完全無降解;提供DNA電泳檢測照片,用自封袋密封后隨樣品一起送樣;組織樣品﹥1.5 g。
3、樣品保存期間切忌反復凍融。
4、送樣管務必標清樣品編號,管口使用Parafilm膜密封。
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