
?微生物基因組從頭測序
概述:微生物廣泛存在于自然界中,與人類的生產和生活息息相關。微生物生物多樣性豐富,基因組具有相對較小、重復序列較高、易于突變等特點,因此很必要對微生物進行全基因組測序,而且同動植物相比較在時間和成本上也容易實現。目前,全基因組測序成為微生物遺傳進化、疾病預防控制、生物工程技術等方面重要的研究和開發手段。
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常見問題
微生物廣泛存在于自然界中,與人類的生產和生活息息相關。微生物生物多樣性豐富,基因組具有相對較小、重復序列較高、易于突變等特點,因此很必要對微生物進 行全基因組測序,而且同動植物相比較在時間和成本上也容易實現。目前,全基因組測序成為微生物遺傳進化、疾病預防控制、生物工程技術等方面重要的研究和開 發手段。
1、細菌:Miseq DNA PE文庫濃度≥20 ng/ μl,總量≥6 μg(熒光定量);Miseq DNA MP文庫濃度≥40 ng/ μl,總量≥12 μg(熒光定量);454 DNA庫濃度≥20 ng/ μl,總量≥3 μg(熒光定量)。電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整,主帶應在100 kb以上,DNA無降解,無污染提供菌粉>1 g,菌液>5 ml,盡量提供較多量,不同的物種DNA提取產量有差異。
樣品要求
2、 真菌:Miseq DNA PE 文庫濃度≥20 ng/ μl,總量≥6 μg(熒光定量);Miseq DNA MP 文庫濃度≥40 ng/ μl,總量≥12 μg(熒光定量);454 DNA庫濃度≥20 ng/ μl,總量≥3 μg(熒光定量)。提供組織樣品應>1 g,盡量提供較多量,不同的物種DNA提取產量有差異。
3、樣品保存期間切忌反復凍融。
4、送樣管務必標清樣品編號,管口使用Parafilm 膜密封。
5、提供DNA電泳檢測照片,用自封袋密封后隨樣品一起送樣。