
?轉錄組(mRNA)測序與云計算數據分析
概述:轉錄組學(transcriptomics)是在基因組學后新興的一門學科,即研究特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA(包括mRNA和非編碼RNA)的類型與拷貝數。Illumina提供的mRNA測序技術可在整個mRNA領域
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常見問題
轉錄組測序(transcriptome sequencing)的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,可從整體水平研究基因功能以及基因結構,發現不同生理或者病理狀態下細胞、組織或個體內差異表達的基因。目前已廣泛應用于基礎研究、分子育種、臨床診斷和藥物研發等領域。
應用領域
樣品要求
應用領域

分析平臺特色
- 接收到用戶數據后分析報告的交付周期從傳統的2周提高到1天。
- 彈性計算可以同時計算大量的訂單,免去用戶排隊的煩惱。
- 平臺運維智能化,提供良好的用戶體驗。
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樣品要求
1. 總RNA:針對Illumina測序平臺,濃度≥80 ng/ul,總量≥12 μg;OD260/280介于1.8-2.2之間,OD260/230值應≥2.0。電泳檢測28S:18S至少大于1.5;并確保RNA無降解,無污染。
2. 組織樣品:動物、植物、微生物總量大于500 mg的新鮮樣品(植物材料應盡量選取幼嫩部位)。采樣后將樣品立即用RNAlater和液氮速凍,保存于-80℃(保存期不超過一個月),送樣時使用干冰運輸(不超過72 h);提取RNA后經變性電泳,保證各RNA條帶清晰、比例適中、完整性好、無降解。特別要求樣品分成3份,方便后續提取,避免同一份樣品反復凍融造成樣品降解。
3. 細胞樣品:先使用TRIzol試劑進行處理,每0.25 mL樣品(5-10×106個細胞)加入0.75 mL TRIzol試劑(可參考TRIzol試劑說明書),于-80℃保存,并提供2-3份該樣品。原則上不接收未經TRIzol處理的細胞樣品。
2. 組織樣品:動物、植物、微生物總量大于500 mg的新鮮樣品(植物材料應盡量選取幼嫩部位)。采樣后將樣品立即用RNAlater和液氮速凍,保存于-80℃(保存期不超過一個月),送樣時使用干冰運輸(不超過72 h);提取RNA后經變性電泳,保證各RNA條帶清晰、比例適中、完整性好、無降解。特別要求樣品分成3份,方便后續提取,避免同一份樣品反復凍融造成樣品降解。
3. 細胞樣品:先使用TRIzol試劑進行處理,每0.25 mL樣品(5-10×106個細胞)加入0.75 mL TRIzol試劑(可參考TRIzol試劑說明書),于-80℃保存,并提供2-3份該樣品。原則上不接收未經TRIzol處理的細胞樣品。
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